Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms