Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Nlrx1Q3TL44 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrx1Q3TL44 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Nlrx1Q3TL44 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrx1Q3TL44 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms