Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stt3bQ3TDQ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stt3bQ3TDQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms