Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem104Q3TB48 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem104Q3TB48 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms