Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VrtnQ3SYK4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VrtnQ3SYK4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms