Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prr27Q3SYJ2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms