Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpm1Q2TV84 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms