Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ush2AQ2QI47 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms