Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cers3Q1A3B0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms