Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lingo4Q149C3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms