Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Perm1Q149B8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Perm1Q149B8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Perm1Q149B8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Perm1Q149B8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Perm1Q149B8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Perm1Q149B8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Perm1Q149B8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Perm1Q149B8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Perm1Q149B8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Perm1Q149B8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Perm1Q149B8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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