Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Spatc1Q148B6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Spatc1Q148B6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Spatc1Q148B6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Spatc1Q148B6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Spatc1Q148B6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Spatc1Q148B6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Spatc1Q148B6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spatc1Q148B6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms