Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gli2Q0VGT2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms