Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms