Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmntd2Q0VET5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmntd2Q0VET5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms