Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab42Q0PD08 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab42Q0PD08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms