Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps8Q0P5W1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms