Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Neurl1bQ0MW30 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Neurl1bQ0MW30 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms