Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kndc1Q0KK55 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kndc1Q0KK55 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms