Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttc21bQ0HA38 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc21bQ0HA38 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms