Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnma1Q08460 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms