Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms