Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MestQ07646 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MestQ07646 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MestQ07646 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MestQ07646 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MestQ07646 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MestQ07646 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MestQ07646 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MestQ07646 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MestQ07646 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms