Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox4Q06831 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms