Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx2Q06348 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrx2Q06348 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms