Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fmn1Q05860 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms