Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox12Q04890 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sox12Q04890 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms