Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnd1Q03719 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnd1Q03719 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms