Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scg2Q03517 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scg2Q03517 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms