Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tff2Q03404 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tff2Q03404 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms