Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thbs2Q03350 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms