Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1sQ02789 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1sQ02789 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms