Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gjb4Q02738 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb4Q02738 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms