Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms