Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VcpQ01853 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VcpQ01853 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms