Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp1Q01514 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms