Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec23aQ01405 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms