Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Top2aQ01320 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms