Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EgfrQ01279 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EgfrQ01279 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EgfrQ01279 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EgfrQ01279 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EgfrQ01279 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EgfrQ01279 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EgfrQ01279 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EgfrQ01279 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms