Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HmgcrQ01237 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HmgcrQ01237 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms