Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms