Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SelpQ01102 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SelpQ01102 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms