Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grin2cQ01098 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2cQ01098 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms