Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Grin2bQ01097 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Grin2bQ01097 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms