Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbp1Q00915 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms