Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SeleQ00690 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms