Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga4Q00651 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms