Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
F8a1Q00558 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms