Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds1P98191 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds1P98191 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms