Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Neo1P97798 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neo1P97798 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neo1P97798 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neo1P97798 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Neo1P97798 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neo1P97798 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neo1P97798 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neo1P97798 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neo1P97798 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neo1P97798 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Neo1P97798 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neo1P97798 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Neo1P97798 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms